我國最早建立水質監測預警系統的是環保系統，1998年以來已覆蓋全國主要水系145個國控重點斷面。根據系統處理數據，環保部每周動態發布水溫、pH、濁度、溶解氧、電導率、高錳酸鹽指數、氨氮和總有機碳等8項水環境指標。除145個國控重點斷面外，環保系統的省、市（縣）監控斷面建立的水環境預警系統數以千計。
與此類似，水利系統采用自動監測與實驗室檢測相結合的方式，建立了各省區和各流域的水質監測預警系統。如長江委所屬長江干支流，目前已有551個水質監測站,共680個監測斷面，監測指標包括氨氮、pH值、硝酸鹽氮、亞硝酸鹽氮、非離子氨、高錳酸鹽指數、生化需氧量、溶解氧、總磷、總砷、總汞、總鎘、總鉛、總銅、總氰化物、揮發酚、石油類、總大腸菌群等18項水環境指標。各地（流域）據此每月發布一次“水資源質量公報”。
2005年北江鎘污染事件后，在廣東省科技廳支持下，佛山市水業集團有限公司聯合北江流域有關供水企業，以協議方式建立了“北江原水水質監測與污染預警系統”，覆蓋韶關、清遠、廣州、佛山4市、17縣共60多個水廠。該系統由4個主要部分組成：①設立在各供水企業的原水水質監測系統；②原水水質信息共享平臺；③原水污染事故發展趨勢模擬系統；④應急處理合作機制。目前，廣東省城鎮供水協會正在努力把這種預警應急合作模式推廣到廣東省的西江、東江、韓江等流域的供水企業。
從合作機制的角度看，“多瑙河事故應急預警系統”，與廣東北江模式極其相似。該系統由德國、奧地利、匈牙利等5個歐洲國家共同開發，由多瑙河沿岸各國的國際警報中心、各國間的信息傳輸系統以及各國內的學術支持機構組成。自1997年投入運行以來，該系統在預測預報多瑙河流域水質變化中發揮了重要作用。
天津芥園水廠和上海某水廠的原水水質監測預警系統，在國內可能具有典型代表性。芥園水廠對濁度、pH值、溶解氧、水溫、氧化還原電位、電導率、氨氮、總磷、大地照度進行在線監測，建立了預測原水中次日葉綠素的決策樹模型，經仿真驗證，模型的平均預測準確率可達到80％。上海某水廠的原水預警系統，其監測系統由綜合毒性儀、紫外光譜掃描儀、其他在線監測儀等可以互相印證和補充的三部分構成。其他在線監測指標為pH值、ORP、渾濁度、氨氮、電導率、亞硝酸鹽、錳，可以實時監測有關水質及氧化環境的動態；綜合毒性儀監測未知污染物的污染水平；而紫外光譜掃描儀可以針對綜合毒性儀監測信息，完成未知污染物的快速定性分析。
4.3 供水系統水質監測預警系統
水專項十一五“飲用水水質監控預警及應急技術研究與示范”項目，集成相關課題成果，在濟南、杭州、東莞示范建設了“城市供水水質監測預警系統技術平臺”，該預警平臺由水質信息采集網絡、數據處理中心、可視化平臺構成。其中，水質信息采集網絡，由水質在線監測系統（包括原水、出廠水、管網水、二次供水）、實驗室水質檢測數據報送系統、異構系統信息接入共享等構成。在線監測的指標包括電導率、pH值、水溫、余氯、濁度、溶解氧、葉綠素、耗氧量、綜合毒性、總磷、氨氮、汞、鋅、鎘、鉛、總有機碳、氰化物等17個。
預警平臺采用的預警技術，包括在線監測和預測模型。利用在線監測信息，可直接對余氯、渾濁度、耗氧量、氨氮、汞、鋅、鎘、鉛、總有機碳、氰化物等10個指標報警；利用電導率，推定氯化物的水平及咸潮入侵情況。利用預測模型和pH值、水溫、溶解氧、葉綠素、綜合毒性、總磷、氨氮等監測數據，可定性分析原水的氧化環境，并配合分析耗氧量、氨氮、總有機碳的水平，對藻類生長及暴發情況實施監控。同時，采用神經網絡模擬，可對管網水質事故的影響范圍、污染程度、持續時間等進行分析判斷。
預警平臺示范項目于2007年進入設計階段，2010年投入運行，事件預測準確率達到80%以上。
總結環保和水利系統的水環境監測預警系統的功能和技術特點，一是基于行政管理的部門職能，支撐國家、省、市（縣）三級監控斷面管理；二是系統主要由水質自動監測站、遠程數據傳輸、數據庫處理等三部分組成；三是系統的功能目前尚未實現“預測”，而是對當前水環境質量的感知和信息統計；四是預警系統的基礎信息并非全部依賴實時在線監測，實驗室檢測數據等其他數據源也可以是預警基礎信息的一部分。原水水質監測預警系統
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